Ihre geografische Lage in direkter Nachbarschaft zu vielen Seen und Flüssen hat vor allem eine Vielzahl von Wassersportvereinen hervorgebracht. Aus diesen gingen letztlich sogar Olympiasieger hervor. Brandenburg an der Havel besitzt mit der Regattastrecke am Beetzsee auch eine Wettkampfstrecke von internationalem Rang. Auf ihr fanden bereits verschiedene nationale und internationale Meisterschaften statt.

Die Stadt arbeitet daran die Wettkampfstrecke so auszubauen, dass auch die Weltmeisterschaft im Rudern dort ausgetragen werden kann. Außerdem bietet das Marienbad sehr gute Voraussetzungen für den Wasserballsport.